臺北帝大時期最初分設(shè)文政、理農(nóng)學(xué)部，學(xué)生約六十人，1936年增設(shè)醫(yī)學(xué)部，1943年增設(shè)工學(xué)部，同年分成文政及理農(nóng)兩個學(xué)部。另外有附屬農(nóng)林專門部、附屬醫(yī)學(xué)專門部、熱帶醫(yī)學(xué)研究所和預(yù)料。該年亦設(shè)置南方人文研究所及南方資源研究所。當時原用講座制度，每一講座由一位專任教授主持，其下編列有副教授、助手、講師和僱員，係經(jīng)費預(yù)算獨立並多附設(shè)圖書室之研究單位。至1945年，擴展為文政、理、農(nóng)、醫(yī)、工五個學(xué)部，有學(xué)生千餘人。

臺灣光復(fù)後，依照我國學(xué)制，分設(shè)系、科，各「學(xué)部」改稱「學(xué)院」，並將文政學(xué)部劃分為文學(xué)院及法學(xué)院，再加上理、醫(yī)、工、農(nóng)共為6個學(xué)院、設(shè)立22門學(xué)系。至36學(xué)年度學(xué)生約為一千八百五十五人。往後，院系隨師資、硬體設(shè)備與社會需求逐漸增加。民國49年試辦夜間部，56年開辦新制夜間部，76年成立管理學(xué)院，82年則成立公共衛(wèi)生學(xué)院，86年成立電機學(xué)院（89年更名為電機資訊學(xué)院）。民國88年原法學(xué)院更名為社會科學(xué)院，所屬法律學(xué)系改制為法律學(xué)院，夜間部與推廣教育中心併編為進修推廣部，91年農(nóng)學(xué)院易名為生物資源暨農(nóng)學(xué)院，92年增設(shè)生命科學(xué)院。臺灣大學(xué)目前已有11個學(xué)院，54個學(xué)系，103個研究所，另設(shè)有人口與性別、凝態(tài)科學(xué)、生物技術(shù)、生物多樣性等4個校級研究中心，連同進修推廣部，學(xué)生總?cè)藬?shù)達到三萬三千餘人，大學(xué)部近一萬七千人，研究生一萬五千餘人，比例大約一比一，已成功轉(zhuǎn)型為研究型大學(xué)。

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